feat: 持久化从 JSON 迁移到 DuckDB，启动自动迁移存量数据并全面异步化

- 新增 src/persistence/duckdbAdapter：与 jsonAdapter 同接口的异步适配器，
  数据存于 data/registry.duckdb，首次启动自动从 JSON 迁移并备份 json-backup-<ts>
- 全部服务层（project/config/user/token）与路由改为 async/await
- MCP 工具与鉴权同步异步化，系统 mode 读写迁移至 DuckDB
- 服务启动流程：init DB -> 自动迁移 -> 确保默认管理员 -> listen
- 新增 DuckDB 往返/迁移测试，测试目录隔离 REGISTRY_DATA_DIR

test/mcp.test.js

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  */
 const test = require("node:test");
 const assert = require("node:assert");
+const fs = require("node:fs");
+const os = require("node:os");
+const path = require("node:path");
 const { createMcpServer } = require("../src/mcp/tools");
-const { loadSystem, saveSystem } = require("../src/persistence/jsonAdapter");
+const { init, loadSystem, saveSystem } = require("../src/persistence/duckdbAdapter");
 
-// 恢复测试前的系统模式，避免影响其他用例
-const originalMode = (loadSystem() || {}).mode || "edit";
-test.after(() => {
-  const system = loadSystem() || {};
-  system.mode = originalMode;
-  saveSystem(system);
-});
+// 使用临时数据目录，避免污染真实 data/
+const tmpDataDir = fs.mkdtempSync(path.join(os.tmpdir(), "registry-mcp-test-"));
+process.env.REGISTRY_DATA_DIR = tmpDataDir;
 
 let server;
-test.before(() => {
+let originalMode = "edit";
+
+// 初始化 DuckDB，记录测试前模式；测试结束后恢复原模式
+test.before(async () => {
+  await init();
+  originalMode = (await loadSystem() || {}).mode || "edit";
   server = createMcpServer();
 });
 
+test.after(async () => {
+  const system = await loadSystem() || {};
+  system.mode = originalMode;
+  await saveSystem(system);
+});
+
 /**
  * 直接调用已注册工具的处理函数
  * @param {string} name - 工具名