feat: 持久化从 JSON 迁移到 DuckDB，启动自动迁移存量数据并全面异步化

- 新增 src/persistence/duckdbAdapter：与 jsonAdapter 同接口的异步适配器，
  数据存于 data/registry.duckdb，首次启动自动从 JSON 迁移并备份 json-backup-<ts>
- 全部服务层（project/config/user/token）与路由改为 async/await
- MCP 工具与鉴权同步异步化，系统 mode 读写迁移至 DuckDB
- 服务启动流程：init DB -> 自动迁移 -> 确保默认管理员 -> listen
- 新增 DuckDB 往返/迁移测试，测试目录隔离 REGISTRY_DATA_DIR

package.json

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   ],
   "license": "MIT",
   "dependencies": {
+    "@duckdb/node-api": "^1.5.5-r.5",
     "@modelcontextprotocol/sdk": "^1.30.0",
     "express": "^4.18.2"
   }